近年来主要从事海水鱼类免疫学、应激生理学及疾病控制等方面研究。主持国家基金重点项目、国家杰出青年基金、“973”计划课题、促海峡两岸联合基金重点项目、海洋公益专项等20余项课题。在我国重要海水经济鱼种大黄鱼免疫与应激反应的分子机制方面取得了重要研究成果。完成了大黄鱼全基因组测序，获得了其基因组精细图谱；揭示了神经-内分泌-免疫/代谢新的调控网络在大黄鱼应答低氧胁迫中发挥重要作用；证明了大黄鱼抗氧化物酶4可通过抑制NF-κB激活负调节促炎因子表达，从而有效抑制过度的应激性炎症反应；鉴定了5种hepcidin活性肽具有不同的功能，即可抑制病原微生物及调控铁稳态平衡。相关研究结果在PLOS Genetics、J Proteome Res、Frontiers Immunol等国际刊物发表SCI收录论文90篇；获省部级科技成果奖5项；授权国家发明专利18项。