成果简报

在国家海水鱼类产业技术体系等项目支持下，卵形鲳鲹种质资源与品种改良岗位与中国水产科学研究院生物技术研究中心合作，成功破译卵形鲳鲹基因组，绘制了卵形鲳鲹基因组染色体图谱，研究成果于10月22日正式发表在Scientific Data杂志（IF=5.9）。该研究利用第二、三代测序和Hi-C染色体构象捕获技术，构建了卵形鲳鲹染色体水平的基因组图谱。研究揭示卵形鲳鲹基因组大小为655 Mb，contig N50和scaffold N50分别达到1.80 Mb和5.05 Mb，利用Hi-C技术成功将99.4%的组装序列挂载到24条染色体上，染色体平均长度为26.84 Mb，鉴定出21915蛋白编码基因。多种指标表明该基因组图谱具有高可靠性。比较基因组分析卵形鲳鲹基因组与近缘物种基因组具有高度共线性和保守性。

卵形鲳鲹俗称金鲳，具有生长快、肉质鲜美、全程可摄食人工配合饲料、养殖周期短和适合深水抗风浪网箱养殖的特点，是拓展深远海养殖的重要品种之一，目前是我国海南、广东和广西深水抗风浪网箱养殖的主要品种。随着其养殖规模的不断扩大，种质退化、病害频发等问题逐渐显露。卵形鲳鲹基因组图谱的完成，为深入解析其重要经济性状的遗传基础，开展基因组选择育种和分子设计育种等工作奠定了基础。

卵形鲳鲹种质资源与品种改良岗位科学家张殿昌研究员及团队成员郭梁助理研究员、郭华阳助理研究员和朱克诚副研究员为该论文的共同第一作者，张殿昌研究员和李炯棠研究员为该论文的共同通讯作者。

全文链接：

https://www.nature.com/articles/s41597-019-0238-8